Parmi ses prérogatives, figure notamment la surveillance des éventuelles épidémie et pandémie. Une épidémie correspond au développement rapide et soudain d'une maladie qui touche un grand nombre de personne sur un territoire donné (par exemple, épidémie de gastro-entérite ou grippe saisonnière). Dès que l'épidémie se répand à l'échelle mondiale (au moins 3 pays touchés), on parle de pandémie.
- Niveau 1 : Virus déclaré chez l'animal mais pas de contamination des humains.
- Niveau 2 : Virus animal provoquant des infections chez l'homme. Le virus est dès lors considéré comme une menace de pandémie potentielle.
- Niveau 3 : Virus présent chez des humains sans que sa transmission d'homme à homme ne soit suffisante pour provoquer une épidémie.
- Niveau 4 : Propagation localisée du virus. Une épidémie est en cours car le virus s'est adapté à l'homme.
- Niveau 5 : Transmission d'homme à homme dans plus d'un pays. Développement de plusieurs foyers d'infections.
- Niveau 6 : Présence de foyers d'infection par le virus dans au moins 2 régions du monde (ou dans 3 pays). Une pandémie est en cours.